Bioinformatics and Information Technology in Biotechnology

Major: Biotechnology and Bioengineering
Code of subject: 8.162.00.O.3
Credits: 3.00
Department: Technology of Biologically Active Substances, Pharmacy and Biotechnology
Lecturer: Ph.D., Associate Professor Petrina Romana Ph.D., assistant Monka Natalia
Semester: 1 семестр
Mode of study: денна
Learning outcomes: • Knowledge of modern research methods in the field of biotechnology, bioengineering and bioinformatics to create new biotechnological objects. • Search, analyze and critically evaluate information from various sources. • Research and model processes in biological systems. • Apply a systematic approach, integrating knowledge from other disciplines and taking into account non-technical aspects, when solving theoretical and applied problems of the chosen field of research.
Required prior and related subjects: Prerequisites: Molecular biology; Bioengineering (cell and genetic); Genetics (general and molecular) Co-requisites: Molecular biotechnology and bioengineering; Biotechnology and bioengineering of plants and genome analysis methods; Physico-chemical and biophysical methods of bioorganics identification
Summary of the subject: Principles of bioinformatics. Information technology and processes. Information technology in the systems of management. Computer systems in technology, organization, planning and management. Information technology in education. Working with scientific literature: Google Scholar, Microsoft Academic Search, Publish or Perish, PubMed, Scopus, Mendeley. Sources of biological information and databases online. Classification and types of databases. Biological sequences. Information in molecular biology. Genome and proteome. Genomics. Genome mapping. Proteomics. Protein structure and informatics. Methods of bioinformatical analysis. Substitution matrix. The algorithms of sequences alignment. Phylogenetic analysis. Information principles in biotechnology. Sequencing of biological sequences and gene expression. The functioning and organization of genomes. Analysis of the genomes. Analysis and prediction of protein. Bioinformatics in pharmaceutical biotechnology. Medical genomics and pharmacogenomics. The technology of computer modelling. In silico methods in developing of new bioactive substances.
Assessment methods and criteria: • oral questioning, individual works – 20 points; • final control (exam) – 80 points (written-oral form).
Recommended books: 1. Огурцов А.Н. Основы биоинформатики.– X.: НТУ «ХПИ», 2013. – 400 с. 2. Медична інформатика : навчальний посібник / О.В. Сілкова, Н.В. Лобач ; МОЗ України, УМСА. – Вид. 2-ге, змін., випр. – Полтава : АСМІ, 2016. – 262 с. 3. Medical informatics : tutorial guide / S. Yu. Olenets ; Ministry of health of Ukraine, UMSA (Poltava), Department of medical informatics, medical and biological physics = Медична інформатика : навчальний посібник / С. Ю. Оленець ; МОЗ України, УМСА,. – Poltava : РВВ УМСА, 2017. – 159 p. 4.Сілкова О.В., Мороховець Г.Ю. Біоінформатика. Вступний курс / 118 Сілкова О.В., Мороховець Г.Ю. О.В. Сілкова, Г.Ю. Мороховець. – Полтава: Шевченко Р.В., 2017. – 118 с. 5. Кисляк, С. В. Основи молекулярної біології та біоінформатики: комп`ютерний практикум: навчальний посібник для студентів спеціальності 122 «Комп`ютерні науки та інформаційні технології спеціалізації «Інформаційні технології в біології та медицині» / С. В. Кисляк, Є. А. Настенко ; КПІ ім. Ігоря Сікорського. – Електронні текстові дані (1 файл, 3,09 Мбайт). – Київ : КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2018. – 96 с.